荧光显微镜是以紫外线为光源，用以照射被检物体，使之发出荧光，然后在显微镜下观察物体的形状及其所在位置。荧光显微镜是基于荧光成像进行光度分析的光学测量仪器，广泛用于生命科学研究和临床实验室诊断等领域。
荧光显微镜的校准
荧光显微镜比普通显微镜复杂，使用也比较麻烦，但只要注意下面几点，用户自行作些校准还是很容易的。
1、汞灯的校准
基于荧光显微镜的原理，决定了选用汞灯作为其光源。由于标本产生的荧光比较弱，为了得到较亮的图像，汞灯的校准至关重要。具体校准步骤如下：
①开启汞灯后，在荧光显微镜工作台上放一张白纸，并从物镜转换器中转出物镜，即转换器上出现的空孔位于光轴上，卸去转换器上保护盖(如无空孔，可卸掉一个低倍物镜，校准完毕后再旋上)。转动荧光显微镜主体内的滤光片座，选一个透过绿光的滤光片组，使反射照明有光通过物镜转换器孔，此时在白纸上可以看到汞灯照亮的光斑。如光斑太亮，可以插入中性滤光片，或带上太阳眼镜，以保护眼睛。
②转动聚光镜调焦旋手，使汞灯光弧在白纸上成像清晰。因汞灯室内装有一个球面反光镜，用来增加亮度，于是在白纸上看到两个光弧的像。旋转汞灯调节旋手和反光镜位置调节旋手，使两个光弧并立。再转动反光镜聚焦调节旋手，使两个光弧有接近相等的亮度。
③旋转汞灯调节旋手和反光镜位置调节旋手，使两个光弧重合。再调节聚光镜调焦旋手，得到放大和均匀的光弧像。这样汞灯校准工作就完成了。转入物镜后，根据物镜具体倍率，稍微调节一下聚光镜调焦旋手就可以了。
